干货分享丨免疫原性新抗原的鉴定、预测和验证
新抗原的鉴定是开发有效免疫疗法的关键步骤。目前,基于全基因组测序(WES)、RNA-seq和TCGA蛋白组学数据的融合,可以在整个癌症谱中筛选新抗原。然而,鉴于肿瘤类型、肿瘤病变和患者的广泛差异,定制的免疫治疗需要基于不同的患者和肿瘤特征鉴定和预测新抗原。预测免疫原性需要鉴定基因的突变以及患者MHC分型的详细信息,因为肿瘤新抗原对突变免疫反应的顺序刺激取决于几个变量:肽段的翻译和加工、MHC分子对突变肽的呈递以及pMHC复合物与TCRs的亲和力。鉴定新抗原表位有两种主要策略:①免疫基因组学方法:基于NGS的计算机方法创建虚拟肽组;②免疫肽组学方法:使用MS分析MHC结合肽段。
1237 人阅读发布时间:2024-07-24 15:25